Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms