Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms