Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

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Length 780 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Glis3Q6XP49 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Glis3Q6XP49 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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Glis3Q6XP49 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Glis3Q6XP49 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Glis3Q6XP49 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Glis3Q6XP49 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Glis3Q6XP49 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Glis3Q6XP49 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms