Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms