Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms