Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms