Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim45Q6PFY8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms