Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms