Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff1Q6PFE7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff1Q6PFE7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff1Q6PFE7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff1Q6PFE7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff1Q6PFE7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff1Q6PFE7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff1Q6PFE7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff1Q6PFE7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff1Q6PFE7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff1Q6PFE7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff1Q6PFE7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff1Q6PFE7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff1Q6PFE7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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