Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms