Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms