Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms