Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm4Q6IRU2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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