Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms