Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spty2d1Q68FG3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Spty2d1Q68FG3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms