Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms