Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Sp9Q64HY3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Sp9Q64HY3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Sp9Q64HY3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Sp9Q64HY3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sp9Q64HY3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms