Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VclQ64727 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VclQ64727 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VclQ64727 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VclQ64727 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VclQ64727 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VclQ64727 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VclQ64727 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VclQ64727 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VclQ64727 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VclQ64727 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VclQ64727 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VclQ64727 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VclQ64727 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VclQ64727 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VclQ64727 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VclQ64727 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VclQ64727 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VclQ64727 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VclQ64727 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VclQ64727 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VclQ64727 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VclQ64727 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VclQ64727 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VclQ64727 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VclQ64727 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VclQ64727 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VclQ64727 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VclQ64727 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VclQ64727 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VclQ64727 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VclQ64727 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VclQ64727 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VclQ64727 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VclQ64727 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VclQ64727 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VclQ64727 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VclQ64727 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VclQ64727 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VclQ64727 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VclQ64727 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VclQ64727 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VclQ64727 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VclQ64727 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VclQ64727 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VclQ64727 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms