Protein–RNA interactions for Protein: Q64522

Hist2h2ab, Histone H2A type 2-B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2abQ64522 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hist2h2abQ64522 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hist2h2abQ64522 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms