Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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PtprdQ64487 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PtprdQ64487 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PtprdQ64487 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PtprdQ64487 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprdQ64487 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms