Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20854Q62461 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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