Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms