Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rai1Q61818 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms