Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd47Q61735 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd47Q61735 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms