Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms