Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms