Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms