Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk1Q60855 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk1Q60855 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk1Q60855 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk1Q60855 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk1Q60855 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk1Q60855 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk1Q60855 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk1Q60855 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk1Q60855 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk1Q60855 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk1Q60855 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk1Q60855 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk1Q60855 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk1Q60855 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk1Q60855 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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