Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2dQ60773 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms