Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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