Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf12Q5SPL2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms