Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdh12Q5RJH3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdh12Q5RJH3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdh12Q5RJH3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdh12Q5RJH3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdh12Q5RJH3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdh12Q5RJH3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdh12Q5RJH3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdh12Q5RJH3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdh12Q5RJH3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms