Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlha9Q5RJB0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms