Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Gm11487Q5RIS0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm11487Q5RIS0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm11487Q5RIS0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm11487Q5RIS0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm11487Q5RIS0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Gm11487Q5RIS0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Gm11487Q5RIS0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Gm11487Q5RIS0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Gm11487Q5RIS0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Gm11487Q5RIS0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Gm11487Q5RIS0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Gm11487Q5RIS0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Gm11487Q5RIS0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Gm11487Q5RIS0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Gm11487Q5RIS0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Gm11487Q5RIS0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Gm11487Q5RIS0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Gm11487Q5RIS0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm11487Q5RIS0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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