Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gm3558Q5FWC9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gm3558Q5FWC9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gm3558Q5FWC9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gm3558Q5FWC9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm3558Q5FWC9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm3558Q5FWC9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm3558Q5FWC9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm3558Q5FWC9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm3558Q5FWC9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm3558Q5FWC9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm3558Q5FWC9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm3558Q5FWC9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms