Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm2Q5FW85 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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