Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdp2Q504M2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms