Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms