Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5935Q497S0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5935Q497S0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5935Q497S0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5935Q497S0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5935Q497S0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5935Q497S0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5935Q497S0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5935Q497S0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5935Q497S0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5935Q497S0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5935Q497S0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm5935Q497S0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm5935Q497S0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm5935Q497S0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm5935Q497S0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm5935Q497S0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5935Q497S0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms