Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms