Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
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Lrrc43Q3V0L5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Lrrc43Q3V0L5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Lrrc43Q3V0L5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Lrrc43Q3V0L5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Lrrc43Q3V0L5 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc43Q3V0L5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Lrrc43Q3V0L5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Lrrc43Q3V0L5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Lrrc43Q3V0L5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Lrrc43Q3V0L5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Lrrc43Q3V0L5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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