Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc27Q3V036 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms