Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms