Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms