Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga4Q3UW12 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga4Q3UW12 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms