Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms