Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rtl4Q3URY0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rtl4Q3URY0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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