Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep63Q3UPP8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms