Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms