Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp30Q3UN04 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp30Q3UN04 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp30Q3UN04 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp30Q3UN04 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Usp30Q3UN04 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Usp30Q3UN04 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Usp30Q3UN04 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp30Q3UN04 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp30Q3UN04 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp30Q3UN04 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp30Q3UN04 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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